本中心下辖部门，分为行政、技术、生产和保障四类，其中：行政副主任分管行政和保障部门，技术副总分管技术和数据采集部门，各部门主要职责分别如下：
    （1）行政办公室：主要负责工程中心的日常事务处理，物资、库存及资料保管，文件标准化制度确定等行政管理工作，协助技术部门开展系统可靠性分析论证、贯标等具体工作。预备期后还将负责科技成果的推广与转化工作。
    （2）技术部门：下设总体设计、智慧建材、物联网建筑、BIM技术和大数据建筑等研究室，主要负责智慧建筑及相关领域工程项目的各项技术工作；瞄准智慧建筑产业技术制高点、开展技术合作、组织技术攻关等。
    （3）数据采集部门（实验室与采集平台）：含综合实验室、大数据实验室，主要是根据技术部门的建筑及相关领域工程项目的数据采集工作。
    （4）保障部门：负责试验运行前后的各种保障工作等具体工作。